納米孔測(cè)序技術(shù)結(jié)合元基因組分析可快速檢測(cè)埃博拉病毒
美國(guó)研究人員近日完成的一項(xiàng)原則證明性研究稱，基于DNA排序的實(shí)時(shí)血液檢測(cè)，可迅速對(duì)埃博拉出血熱、基孔肯雅熱等危重傳染病進(jìn)行診斷。研究人員表示這項(xiàng)檢測(cè)未來有望用于實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地和醫(yī)療設(shè)施缺乏的地區(qū)。
大多數(shù)商用或科研用基因診斷是以特定的病原體為目標(biāo)。但美國(guó)加州大學(xué)舊金山分校檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)副教授查爾斯·邱（音譯）領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)出的新檢測(cè)技術(shù)，則不要求預(yù)先識(shí)別出嫌疑病原體。這種在臨床所有DNA樣本中不知道哪種是正在被拿來檢測(cè)的公正無預(yù)判的分析手段，被稱為元基因組分析法，已用于對(duì)埃博拉病毒的檢測(cè)。
2014年，運(yùn)用這種方法，該研究團(tuán)隊(duì)檢測(cè)了一名來自威斯康星州患有嚴(yán)重腦炎的男孩脊髓液中的所有DNA樣本，診斷出了一種罕見的病毒，在醫(yī)學(xué)界引起了強(qiáng)烈反響。但當(dāng)時(shí)診斷費(fèi)時(shí)兩天。此次，研究團(tuán)隊(duì)對(duì)兩位來自非洲的埃博拉患者儲(chǔ)存血液樣本中的遺傳指紋進(jìn)行檢測(cè)。整個(gè)診斷過程持續(xù)五小時(shí)，而DNA測(cè)序本身才花費(fèi)了10分鐘。在本次檢測(cè)中，研究人員開發(fā)了可在筆記本上使用的分析和可視化軟件，并利用了新興的DNA測(cè)序技術(shù)——納米孔測(cè)序技術(shù)來輔助實(shí)驗(yàn)，大大提高了獲取實(shí)驗(yàn)結(jié)果的速度。
納米孔測(cè)序技術(shù)是DNA第四代最先進(jìn)的測(cè)序技術(shù)。該技術(shù)通過測(cè)量對(duì)不同核酸通過納米孔時(shí)對(duì)電流產(chǎn)生的微弱擾動(dòng)差異，來識(shí)別不同堿基。納米孔測(cè)序裝置不僅體積小，攜帶方便，還可以實(shí)時(shí)、直接生成實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)，使基因測(cè)序過程變得迅速了許多。
研究團(tuán)隊(duì)還檢測(cè)了波多黎各正在暴發(fā)的基孔肯雅熱的致病病毒。他們從一位并未表現(xiàn)出任何癥狀的當(dāng)?shù)孬I(xiàn)血者的血液樣本中迅速檢測(cè)到了基孔肯雅病毒，該獻(xiàn)血者最終報(bào)告發(fā)燒并伴有關(guān)節(jié)疼痛。
查爾斯·邱指出，將納米孔測(cè)序技術(shù)運(yùn)用于實(shí)時(shí)元基因組檢測(cè)病原體的方法，將為傳染病診斷帶來根本上的改變。
新研究2015年9月29日發(fā)表在《基因組醫(yī)學(xué)》雜志官網(wǎng)上。
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