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腸道病毒EV71核酸檢測試劑盒(PCR-熒光探針法)

2013-9-5 17:21:51??????點擊:

名 】                                                                   

中文名:腸道病毒71型(EV71)核酸擴增檢測試劑盒

英文名:human enterovirus type 71 (EV71) Fluorescence Quantitative Polymerase Chain Reaction (PCR) Diagnostic Kit

漢語拼音: chang dao bing du 71 xing  he suan kuo zeng jian ce shi ji he 

【目的】

本試劑盒適用于檢測疑似患者糞便、咽拭子標本、皰疹液或腦脊液等標本中腸道病毒71型(EV71)mRNA,適用于腸道病毒71型感染引起的手足口病的輔助診斷。其檢測結(jié)果僅供參考。

原理

本試劑盒用Trizol提取腸道病毒71型(EV71)mRNA,經(jīng)過逆轉(zhuǎn)錄作用生成cDNA,用一對腸道病毒71型(EV71)特異性引物結(jié)合一條特異性熒光探針,配以FQ-Buffer(內(nèi)含Mg2+、Tris-HCl等)、耐熱DNA聚合酶(Taq酶)、四種核苷酸單體(dNTPs)等成分,通過一步PCR-熒光探針體外擴增法對腸道病毒71型(EV71) RNA進行擴增,從而達到快速實時定量檢測之目的。 

組成

名      稱

數(shù)      量

規(guī)      格

EV71 PCR MIX

1    管

800μl/管

酶反應系

1    管

80μl/管

EV71陽性質(zhì)控品

1    管

100μl/管(1×107Copies/ml)

陰性質(zhì)控品

1    管

250μl/管

DEPC水

1    管

2000μl/管

備注:Trizol等另行配備

【標本采集】

1. 適用標本類型:疑似病人糞便、咽拭子標本、皰疹液、腦脊液或病毒分離培養(yǎng)物標本等

2. 標本采集:  

咽拭子標本:采集病人發(fā)病3日內(nèi)的咽拭子標本,用專用采樣棉簽,適度用力拭抹咽后壁和兩側(cè)扁桃體部位,應避免觸及舌部;迅速將棉簽放入裝有3~5ml保存液(維持液或生理鹽水)的采樣管中,在靠近頂端處折斷棉簽桿,旋緊管蓋并密閉送檢。

皰疹液:用75%的酒精對皰疹周圍的皮膚進行消毒,然后用消毒針將皰疹挑破用棉簽蘸取皰疹液,迅速將棉簽放入內(nèi)裝有3~5ml保存液(維持液或生理鹽水)的采樣管中,在靠近頂端處折斷棉簽桿,旋緊管蓋并密封。

腦脊液標本:出現(xiàn)神經(jīng)系統(tǒng)癥狀后3天內(nèi),采集量為1.0~2.0ml。采集后立即裝入無菌帶墊圈的凍存管中。密閉送檢測。

糞便:用滅菌捻拭子拭取糞便或腹瀉物置入無菌玻璃管(含0.4ml 滅菌生理鹽水),用無菌棉球?qū)⒃嚬苋o后,密閉送檢。

【保存和運輸】上述標本短期內(nèi)可保存于-20℃,長期保存可置-70℃,但不能超過6個月,標本運送應采用0℃冰壺,采集標本應立即(12h內(nèi))送達實驗室。

適用儀器】主要包括ABI GeneAmp PCR System7700、ABI GeneAmp PCR System7500, ABI PRISM 7300, LightCycler等,LightCycler等毛細管的儀器,MJ Opticon系列或取得資格認證的定量PCR儀。

使用方法

1.RNA提取

1.1樣品處理

取50ul樣品(或陰性質(zhì)控品)加入150 ul Trizol reagents(RNA提取液)充分震蕩,室溫放置10min。

1.2.加入100ul氯仿,用力震蕩15s,室溫靜置5min, 4℃ 12,000rpm離心10min。

1.3.小心將上層水相轉(zhuǎn)移到干凈離心管中,加等體積異丙醇,充分混勻,12,000rpm離心10min。

1.4.棄上清,加入500 ul 75%的DEPC乙醇,充分混勻,12,000rpm離心10min,小心吸去大部分乙醇。

1.5.將提取管敞口在室溫空氣中干燥5min待乙醇揮發(fā)干凈,用20μl DEPC H2O溶解沉淀。

EV71陽性質(zhì)控品:直接取3μl進行PCR擴增。 

2.PCR擴增

從試劑盒中取出EV71 -PCR MIX、酶反應系,室溫融化并振蕩混勻后,10,000rpm離心10s。

設(shè)所需要的PCR反應管管數(shù)為N(N=樣本數(shù)+1管陰性對照+1管陽性對照),每個測試反應體系配制如下表:

試劑

EV71 -PCR MIX

酶反應系

用量

20μl

2μl

計算好各試劑的使用量,加入一適當體積潔凈0.2ml離心管中,充分混勻,10,000rpm離心10s,向設(shè)定的N個PCR反應管中分別加入22μl,向每管中加入處理后樣品(提取RNA)或EV71 -陽性質(zhì)控品陰性質(zhì)控品3μl,10,000rpm瞬時離心10秒。將各反應管放入定量PCR儀器的反應槽內(nèi),按對應順序設(shè)置陰性質(zhì)控品,陽性質(zhì)控品以及未知標本,并設(shè)置樣品名稱、標記熒光基團種類(報告基團FAM、猝滅基團TAMRA)和循環(huán)條件:

ABI PRISM 7700,ABI PRISM5700,ABI GeneAmp 7000 (需要剪掉反應蓋),ABI PRISM7300/7500(使用8聯(lián)管),MJ Opticon(使用8聯(lián)管)等使用薄壁管的儀器:循環(huán)條件: 30℃→5min,42℃→45分鐘,后93℃→2分鐘,后93℃ 30秒→55℃ 45秒, 40個循環(huán)。

LightCycler等使用毛細管的儀器: 循環(huán)條件: 30℃→5min,42℃→45分鐘,93℃→2分鐘,后93℃ 5秒→58℃ 45秒,共40個循環(huán)。

3. 結(jié)果分析判定

Ct 值小于37個循環(huán)的為陽性;Ct 值在37-40個循環(huán)之間,為灰區(qū),需要進行重復試驗。重復試驗之后,如果Ct 值仍然在37-40個循環(huán)之間,判斷為陽性,沒有熒光值增長為陰性(<5×102Copies)。

質(zhì)控標準

陰性質(zhì)控品:全部陰性

EV71 -陽性標準品:陽性對照的 Ct 值均應小于 30.0,且呈標準S型擴增曲線。

以上條件應同時滿足,否則,此次試驗視為無效,全部試驗應重新進行。

注意事項

初次使用前請仔細閱讀說明書。并嚴格按照說明書操作進行。

所有使用的離心管應高壓滅菌(推薦使用,而且必須不含RNA酶。

PCR操作應嚴格按照要求分區(qū)(試劑配制區(qū)、標本處理區(qū)、PCR擴增區(qū)等),防止實驗室污染。

試劑盒里不同組分不能混用。每盒試劑請于3 次內(nèi)使用完畢。

所有試劑及待檢標本應看作是傳染物質(zhì)。

【規(guī)格】40份/盒。

【貯藏及有效期】試劑盒應-20℃閉光保存,避免反復凍融。有效期10個月.